马来西亚位于北纬1°－6°30'、东经100°－120°之间，其领土由不相连接的东西两块土地上的三个地区所组成，隔南海（相距约643公里）相望。
西部称为西马来西亚（简称西马），包括马来西亚半岛的11个州，是马来西亚联邦中面积最大、人口最多的一部分；
东部称为东马来西亚（简称东马），包括沙捞越和沙巴两个州。
西马位于马来西亚半岛的南端，东马位于加厘曼丹的北部，北边与文莱接壤，整个马来西亚地处亚洲东南部，介于太平洋与印度洋之间。
西马西部是马六甲海峡，为欧、亚、澳、非四大洲海上航运的重要通道，战略地位重要。
东部是南海。东马北部是南海，东北部是巴拉巴克海峡和苏禄海。
全境面积33.67万平方公里,其中,西马面积13.47万平方公里,东马面积20.20万平方公里。
马来西亚海岸线曲折,全长4192公里,其中,西马海岸线长2000公里。
大陆架由中、南和东巽他陆架所组成，与印度尼西亚、越南和菲律宾相联，200海里等深线内的大陆架面积约41.8万平方公里,
若按大陆架面积计算,东马约占一半,但西马周围整个地区是由水深100米或浅于100米的大陆架所组成。
200海里专属经济区面积475741平方公里。其中，西马约22.4万平方公里。
马来西亚周围各海域都属热带海域，估计表层水温年平均28℃，气温引起的轻微变化在1.5℃左右。全年无台风影响。
