2006年11月，马来西亚依斯干达正式由柔佛州已故苏丹依斯干达，并在首相与州务大臣的见证下隆重推出。
根据该计划，5个“旗舰区”的221,634.1公顷（2,216.3平方公里）已被确定为发展重点。
其中的4个旗舰区位于“努沙再也- 新山- 巴西古当别经济走廊”（SEC）中。
这经济走廊 中包括了丹绒伯勒巴斯港口、巴西古当港口与丹绒浪塞港口以及努沙再也为优先发展的重点。
新山市为旗舰A区，这包括重点发展新山是新的金融区、中央商务区、金海湾河滨城市、地不佬以及新柔长堤的周边。
努沙再也为旗舰B区，这包括发展努沙再也成为柔佛新的行政中心、医疗中心、教育中心、一个国际化的渡假胜地、一个物流产业的集中地以及豪华的别墅胜地。
柔佛西部为旗舰C区，这包括发展丹绒伯勒巴斯港口（PTP）。
