全国有良好的公路网，公路和铁路主要干线贯穿马来半岛南北，航空业亦较发达。
公路：2003年全国公路总长75893公里。截至2005年底，注册交通工具1480万辆。
铁路：2003年总长2267公里，主要贯穿马来半岛。
水运：内河运输不发达，海运80%以上依赖外航。
共有各类船只1008艘，其中100吨位以上的注册商船508艘，注册总吨位175.5万吨；远洋船只50艘。
共有19个港口。大力发展远洋运输和港口建设，主要航运公司为马来西亚国际船务公司，主要港口有巴生、槟城、关丹、新山、古晋和纳闽等。
空运：民航主要由马来西亚航空公司经营，有飞机110余架，开辟有航线113条，其中80条为国际航线。
1996年11月，第二家航空公司——亚洲航空公司投入运营。全国共有机场37个，
其中有5个国际机场：吉隆坡国际机场、槟城、浮罗交怡、哥打基那巴鲁和古晋。
