在苏哈托执政时期，出于国家安全的考虑，防止回教势力借行医为名，搞分裂活动，1973年7月12日，印尼卫生部颁发No.37/BirHub/1973条例，
所有印尼的民间巫医（包括中药师和针灸师）必须向当地检察署及卫生部申请准证，才可行医。
此外，雅加达卫生局对中医师在首都地区行医还有特殊规定，中医师必须经过一系列的考试和手续，以认定其资格：
印尼中医协会可以举办公开的“中医师考试”。由一个“考试委员会”负责执行。试卷副本由印尼中医协会审核后连同考试及格的副本送交卫生部存档。
随后，及格者可以通过印尼中医协会的协助，向雅加达卫生局办理行医执照。
1、雅加达卫生局派有关官员共同负责监督中医师的考试。考试分两天进行：第一天为理论考试；第二天为临床考试。
2、雅加达卫生局特别照顾年龄在60岁以上的老中医。他们不需再经过考试，即可申请行医执照。但必须由两名持行医执照的中医师证明其已有若干年的行医经验。
3、由印尼中医协会主办的“传统医学学校”（中医学校）毕业的学员（四年制），其文凭被雅加达卫生局承认，即可申请行医执照。
4、已获行医执照的中医师，其行医执照每两年更换一次，并须由雅加达卫生局局长签署，才可继续行医。
然而，在印尼，只有首都雅加达实行以上考试制度。
印尼的其他各省，仍然保持一年一度的推荐手续；一个中医师要在当地行医，必须通过印尼中医协会向当地检察署及卫生部推荐，取得这两个部门的登记证，才可挂牌行医。
这些规定，规范了中医医师的标准，给其一个法定身份，但由于标准过高，得到中医医师身份，具有行医资格的人较少，在一定程度上限制了中医药的发展。
