巴布亚在苏加诺时代称为西伊利安,在苏哈托统治时改称伊利安查雅，瓦希德主政时尊重当地居民意见复称为巴布亚。
    在当地方言中,巴布亚是从汪洋大海中冒出来的热土的意思。
    自2003年2月起,这块东端地区划分为巴布亚省与西巴布亚省。
    2001年11月通过的第21号特别自治区法令指的只是伊利安查雅省。当时西巴布亚省未成立。
    尤--卡政府明白涉及巴布亚特别自治区的法令有许多问题,因此在 2008年 4月16日出台第1号替代法令的政府条例；
    对2001年21号巴布亚特别自治区法令作出修订，该条例成为巴布亚省与西巴布亚省均为特别自治区的法律基础。
    这二个特别自治区,将如全国其它省及自治区一样，要进行地方政府首长直接选举、地方议会议员、地方代表理事会成员的直接选举。