印尼塞伦德拉王朝于919年被推翻，中爪哇的佛教逐渐式微而被印度教取代；
    大约10年之后，政治和宗教、文化重心不知原因为何移至东爪哇，大部分的居民也成群结队移居到东爪哇。
    这座“婆罗浮屠”就不再受到重视，任凭风雨的剥蚀、1006年马拉比火山爆发的摧残、雷电的闪击，渐渐被掩没在土中；
    而地底下长出来的热带树木，在漫长的岁月中助长了它的根基与繁茂的枝叶，
    不仅裂开了浮屠的岩石，也掩盖了这座丘陵上的寺庙。
    婆罗浮屠被掩埋在黑暗、寂静的地下，17世纪，马来半岛上流行的历史故事，曾提到“婆罗浮屠”；
    自1798年法国拿破伦率远征军占领埃及后，下令挖掘、收集各种古文物。