在海洋渔业合作方面，福建省与印尼取得重要进展，走在全国前列。
    平潭安达远洋渔业有限公司与印尼AG集团合作建立2个渔业基地，
    其中，图尔渔业基地已投运，纳土纳基地正在筹建中。
    在图尔渔业基地内，建设了一座日处理能力为200吨的水产品加工厂、一座年产能力为2000吨的鱼糜加工厂、一座日产20吨的鱼粉加工厂。
    这一系列配套设施可为企业运回自捕鱼提供保障。
    目前安达公司以该渔业基地为平台，共有45艘远洋渔船赴印尼海域生产，每年运回自捕鱼1万多吨，产值1亿多元。
    福州恒盛昌（福建）投资有限公司与印尼材源帝集团签订了共同开发协议，在印尼瑟兰岛投资建设3000公顷的对虾养殖基地；
    平潭县远洋渔业集团有限公司获得印尼政府批准，合作开发位于印尼巴布亚省西部的凯马纳县阿丰那埃特纳海湾7500公顷的网箱养殖基地；
    连江县南洋水产开发有限公司与印尼三林集团公司签订了共同开发协议，
    建设100公顷的新加朗岛网箱养殖基地，第一批渔民已出国奔赴基地生产作业。
    厦门近两年筹建了12条远洋渔业船队，奔赴印尼海域捕捞深海黄鱼、白带鱼、石斑鱼等，发展远洋渔业。