1983年，马可斯的主要反对者阿基诺自美国途经台湾中正国际机场返国后，于马尼拉机场被当众暗杀，引发国内外的一致批判。
    马可斯为重建自身统治的正当性，决定提前一年于1986年2月7日举办总统大选。
    选举过程中，马可斯虽然有国家机器的宣传优势，并且以作票方式控制选举；
    选举结果，马可斯获得选票1080万7179张，而阿基诺夫人科拉桑则获949万1716张票，
    惟政府部门在计票过程之中，许多选票被窜改、大量作废等干预，引爆了更激烈的争议。
    但是马可斯不承认败选，且于2月25日自行举办总统就职典礼。
    当日群众即包围马拉坎南宫，最后在众叛亲离下，马可斯搭乘美军直昇机远走夏威夷。
    1989年9月28日，因心脏病发，病逝于美国檀香山，终年72岁。