1580年葡萄牙殖民者开始在沿海地区贩卖奴隶。16世纪前后，贝宁出现许多小王国和酋长国。17世纪初南部形成阿波美等王国。
1670年西班牙入侵，大肆进行奴隶贸易。18世纪阿波美王国鼎盛时期统一了南部和中部。
1901年沦为德国殖民地。1960年8月1日独立，成立达荷美共和国。
独立后政局动荡，先后发生5次军事政变，12次更换国家元首。
1972年10月26日以陆军副参谋长克雷库少校为首的青年军官发动政变上台，宣布“走社会主义发展道路”，实行一党制，
同时推翻以阿奥马德贝为主席的三人总统委员会，成立军政府。
克雷库自任总统和全国革命委员会主席。
1975年11月30日国名改为贝宁人民共和国，1990年2月实行多党制，同年3月1日又改为贝宁共和国。
1991年3月，尼塞福尔·索格洛在首次多党大选中获胜，当选总统。
1996年3月，克雷库在换届选举中击败索格洛重新执政，2001年3月蝉联。
2006年3月，独立候选人、前西非开发银行行长亚伊在大选中获胜，成为贝民主化以来的第三位总统。
