铁路。全国铁路总长579公里，均为窄轨，一条干线由科托努至巴拉库，全长438公里。
两条支线，分别为108公里和33公里，由于运输量小，经济效益差，基本处停业状态。
港口。科托努港是贝宁唯一的港口，是西非内陆国家的货物集散地、运输枢纽。
主码头长1320米有8个泊位，1个集装箱的泊位和1个滚动船泊位。
海堤长450米，设石油轮泊位，植物油轮泊位和拖轮泊位。
港口水深10－11米，可停泊大型客货轮。
港口年吞吐量为200万吨。
航空。科托努现有的国际机场跑道长2400米，可起降波音747等大型客机。
另外，巴拉库、坎迪、纳迪丹古、萨维、博希孔等有小型机场。
科托努有法航、非航、国泰、南非航空、加蓬航空、加纳航空等航班直飞巴黎、西非和南非一些国家。
目前，政府有计划在科托努北郊再新建一座现代化机场。
