几内亚的各种疾病发病率很高，主要是疟疾、急性呼吸道感染、各类寄生虫、腹泻、皮肤病、外伤和性病等。
其中危害最大的以疟疾为甚，高发季节主要在换季和雨季期间。
几内亚恶性脑疟较少，只要及时预防，及时治疗，疟疾并不可怕。
此外，肠道血吸虫病、蟠尾腺虫病、脑膜炎和霍乱等流行病及肝炎、结核、麻风等传染病还很多。
据了解，全国艾滋病人近一万人，女性多于男性，20-39岁年龄段占75%。
全国有国家级医院2所，行政大区医院7所，专区与省级医院26所，卫生中心349所，卫生站2987所。
此外，另有企业医院两所，美国人开办的国际医疗中心一所，私人药房181所，私人诊所142个。
全国已经形成了一个以国家医院、大区医院、专区与省级医院、卫生中心与卫生站三级医疗卫生防治网。
几内亚卫生部部属医院为亚斯丁医院，驻几内亚的中国医疗队即在这家医院工作。
东卡医院也是首都规模较大的一家。
几内亚没有医药工业，所需药品，医疗器械完全依靠进口。
市场上流通的药品主要来自法国、德国、瑞士等欧洲国家。
中国药品也随处可见，但多为私人贩售，通过几卫生部审核的只有为数不多的几家医药公司。
几内亚药品很贵，所以可随身携带适合自己身体状况的药品。由于几内亚医院条件有限，消毒观念差，所以有病可先找中国医疗队诊治。
在几内亚无法办理医疗保险。
