1999年，科特迪瓦总参谋长盖伊发动军事政变，推翻贝迪埃。
次年盖伊被迫实行民主选举，但是在选举前通过《血统论法案》，
要求总统候选人的父母都必须出生于科特迪瓦，
使反对党领导人瓦塔拉不能参加选举。
最终由知识分子和青年学生组成的科特迪瓦人民阵线赢得了选举，
考古学家巴博成为了新总统。
公知当选的结果并未让穆斯林满意，
他们声称穆斯林瓦塔拉才是真正合法的科特迪瓦总统。
开始酝酿向新政府开战。
2002年科特迪瓦穆斯林发动内战，占据了科特迪瓦北方。
穆斯林叛军袭击了包括首都阿比让在内的众多城市，
公然杀害了前总统盖伊，整个科特迪瓦一时陷入了腥风血雨的混乱之中。
叛军中的很多成员就是原国防军中的穆斯林士兵，
幕后支持者则是布基纳法索等穆斯林邻国。
因为事发突然，科特迪瓦新政府一时措手不及，叛军四处攻城略地，
很多占领了科特迪瓦中北部大片领土。
而新总统巴博在最初的慌乱之后也很快稳住了阵脚，
赢得了大部分国防军以及基督教邻国利比里亚的支持，
秣马厉兵准备大展拳脚，从叛军手中收复失地。
