像西非国家经济共同体、东非共同体、南部非洲发展共同体、中部非洲国家经济共同体等其他非洲地区性经济组织一样，
    东南非共同市场也面临着成员国基础设施建设严重滞后的问题。    新当选的东南非共同市场部长理事会主席，乌干达贸易、工业与合作部长阿梅利亚-齐亚姆巴德说，
    缺乏足够的交通、能源和通讯与信息技术基础设施，严重制约了东南非共同市场区域内国家经济增长和发展。
    如19个成员国的发电装机总容量仅有5万5800兆瓦，
    与法国12万400兆瓦和美国100万兆瓦的发电装机总容量比起来，这就意味着较高的能源价格是东南非共同市场区域扩大生产的主要阻碍。
    而在公路交通方面，每三个非洲农村人口中，只有一个人拥有两公里全天候通行的道路。
    在东南非共同市场大约1200万平方公里的土地上，只有2万8000公里殖民时代的铁路网，
    而国土面积三百万平方公里的印度则有6万3000公里铁路。
    在谈到水运时，齐亚姆巴德注意到，撒哈拉以南非洲有23个港口，货运总量在3亿5000万吨左右，
    相比之下，新加坡港一个港口的货运能力就达4亿7000万吨。
    另外据估计，撒哈拉以南非洲地区互联网用户比例约为15.4%，远低于世界平均水平的35.6%。