军机处的设立，在政制方面进行了权力制衡的有益尝试。
军机处成为中国历史上最为精简、扁平的政府机构，
这或许是这个改革的最大红利：
只有军机大臣、军机章京两层，有官无吏，队伍极其精干，工作流程极其简捷，
再加上明确要求的“勤、速、密”三大工作作风，
令军机处获得了极高的工作效率。
美国学者白彬菊（Beatrice Bartlett）认为，
军机处实现了从“君主专政”向“大臣行政”、
从“直接的君主个人专制”向“君臣联合行政”的转变；
而军机处大臣们参与到皇帝的最高决策过程，实际上并非加强而是削弱了皇帝的独财；
他们对庞大帝国的海量信息进行筛选和处理，协助皇帝抓大放小，
将有限的资源投放到最根本和主要的地方，是提升中央机枢决策效率的关键。
军机处在中国历史上第一次有效地提供了一个管理大国的中性的、非政治化的行政工具，
既大大提高了行政的效率，又避免了其本身成为权争主角的历史怪圈，
这一改革，如同第一阶段推行的“科举、祭孔、祭朱”一样，
成本低、红利不仅丰厚而且惠及整个政权。
这是中国政制上的一大创举，其在权力制衡与监督方面的诸多设计，
迄今依然有着丰富的现实价值。
